En 1995, la Escuela de Psicología UC abrió sus puertas a psicólogos, psicólogas, y otros profesionales del campo de las ciencias humanas, tanto de Chile como de Latinoamérica, para que actualicen sus conocimientos y se formen profesional y académicamente, a través de un programa de Magíster en Psicología.

Luego, dos años más tarde, nacen las tres menciones de este Magíster: Psicología Clínica, Psicología Educacional y Psicología Social Comunitaria.

Posteriormente, el año 2000, comienza el funcionamiento del Doctorado en Psicología, programa que está destinado a formar investigadores de excelencia que puedan contribuir al desarrollo científico de la psicología a nivel nacional como internacional.

Tres años más tarde, la oferta académica en el área de postgrado sigue creciendo con la incorporación de la mención de Psicología de la Salud al Magíster en Psicología. A esto se suma el año 2006, la creación del Doctorado en Psicoterapia, que es realizado en conjunto con el Departamento de Psiquiatría de la UC, el Departamento de Psicología y los Departamentos de Psiquiatría y Salud Mental de la Universidad de Chile.

Otra alianza importante surge el 2008, año en que se crea el Magíster en Dirección Estratégica de Recursos Humanos y Comportamiento Organizacional, que depende de la Facultad de Ciencias Sociales y la Facultad de Ciencias Económicas y Administrativas de la UC.

Uno de los hitos relevantes del 2011 fue la creación del Magíster en Psicología Laboral Organizacional; mientras que el 2012 se funda el Doctorado en Neurociencias. Este último surge como una iniciativa del Centro Interdisciplinario en Neurociencia de la UC, que depende de la Escuela de Psicología, la Facultad de Medicina, la Facultad de Ciencias Biológicas y la Facultad de Química.

A partir del 2012, se revisan los programas de magíster de la Escuela enfatizando el carácter profesional de los mismos. De esta manera, las distintas menciones del Magíster en Psicología se modifican y surgen los actuales Magíster en Psicología Clínica, Magíster en Psicología Educacional y Magíster en Psicología de la Salud. Finalmente, el año 2013, se crean los Magíster en Psicoterapia Psicoanalítica Intersubjetiva y el Magíster en Medición y Evaluación de Programas Educacionales.